Alergija na česen vključuje imunski odziv na beljakovine v česnu, medtem ko pri intoleranci telo težko prebavlja določene snovi, kot so fruktani. Alergija lahko povzroči resne reakcije, intoleranca pa povzroča predvsem prebavne težave. Pravilna diagnoza in izogibanje česnu lahko izboljšata kakovost življenja.

Surov česen vsebuje nestabilen alicin, ki deluje hitro, a lahko draži želodec. Staran (črni) česen vsebuje stabilen S-alil cistein (SAC) z močnejšimi in dalj časa trajajočimi učinki – od zaščite srca, možganov do boljše prebavljivosti. Primeren je tudi za občutljive osebe.